（1）巴氏小体是X染色体高度螺旋化失活而成的，所以可以用碱性染料，如改良苯酚品红染液、龙胆紫染液、醋酸洋红染液等进行染色．正常雄猫体细胞中只有一个X染色体，不会形成有巴氏小体，正常雌猫体细胞中有有2个X染色体，可以形成1个巴氏小体，所以体细胞中有巴氏小体的猫是雌性的．

　　（2）根据题意已知猫的细胞中只有一条X染色体上的基因能表达，其余X染色体高度螺旋化失活成为巴氏小体，如如XXY，多了一个X，变成了一个巴氏小体；XXX的细胞多了两个X，变成了两个巴氏小体．高度螺旋化的染色体上的基因无法解旋，导致转录过程受阻而不能表达．

　　（3）由题意知，控制猫毛皮颜色的基因A（橙色）、a（黑色）位于X染色体上，Y染色体上无等位基因，基因型为XAY的猫毛皮颜色是橙色；基因型为XAXaY的猫的性别是雄性的，其细胞中会发生X染色体的随机失活，只有1条X染色体上的基因能表达，因此观察到的毛皮颜色可能橙色，也可能是黑色．若该雄猫的亲本基因型为XaXa和XAY，说明父本提供的是基因型为XAY的异常配子，该异常生殖细胞的出现是由于精原细胞在减数第一次分裂时同源染色体XA、Y染色体没有分离，移向了细胞的同一极，形成了异常的生殖细胞，与正常的含Ⅹa卵细胞结合所致．

　　故答案为：

　　（1）龙胆紫  醋酸洋红 雌

　　（2）2 转录

　　（3）橙色   雄 橙、黑相间 父方减数第一次